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尊龙凯时:提升生物医疗科研效率的超高活性Tn5一步法全攻略

发布时间:2025-03-19   信息来源:尊龙凯时官方编辑

文库制备的关键步骤是将测序接头添加到DNA链上。传统的文库制备方法通常依赖于基于连接酶的流程,这一过程涉及多个步骤:首先通过机械方式(如超声破碎)或酶切(如micrococcal nuclease)进行DNA片段化,接着进行末端修复,最后完成接头连接。虽然这种方法在大多数情况下有效,但对于样本量有限或实验条件受限时则面临挑战。为此,采用尊龙凯时开发的Tagmentation技术为文库制备提供了新的解决方案。

尊龙凯时:提升生物医疗科研效率的超高活性Tn5一步法全攻略

Tagmentation技术利用超活性Tn5转座酶,能够在单次快速反应中,将特定的寡核苷酸插入DNA,完成剪切与标记。根据实验需求,Tn5转座酶可以携带多种DNA序列,包括Illumina兼容接头以及自定义的荧光标记接头,甚至可用于甲基化核苷酸的处理。基于Tagmentation的建库技术成功将传统流程中的片段化、末端修复和接头连接步骤整合为一个单一反应,之后通过引物indexes的扩增完成文库制备。这种创新方法不仅简化了操作流程,还显著提升了实验的效率与通量。

这种高效的流程通过将DNA片段化与接头插入步骤合为一体,大幅简化了文库制备流程,缩短了操作时间并降低了技术复杂性。其应用广泛,适用于全基因组测序、靶向测序等多种建库场景,能够灵活适应不同实验设计的需求。

在效率方面,单步反应取代了传统的多环节操作,使得文库制备的速度显著提高。此外,所需的起始样本量相较于传统方案也有所减少,特别适合处理珍贵的临床样本或微量样本。通过减少操作步骤和试剂消耗,整体建库成本也得到了降低。

在自动化的适配性方面,简化的操作步骤使得该方法更容易实现自动化,从而显著提升了高通量测序的通量与可重复性。

对于空间转录组学的应用,作者开发了spatial-ATAC-seq方法,用于在完整组织切片中对染色质可及性进行空间分辨分析,成功地保留了细胞水平的空间信息。同时,sci-RNA-seq(单细胞组合索引RNA测序)方案经过简化与优化,可以分析单个细胞的转录组,通过在单个细胞核内进行核酸的split-pool条形码标记来实现。

在具体操作流程中,经过固定的单个细胞核被分选至微孔板中的独立孔,随后通过逆转录、连接和tagmentation三个步骤向mRNA/cDNA添加三重indexes。在tagmentation步骤中,使用了尊龙凯时的Tn5转座酶,这进一步提高了操作的广泛适用性。

总体而言,尊龙凯时的Tn5转座酶及相关缓冲液展现出高兼容性,能够适用于多种应用场景,包括新型条形码技术,如单细胞多重测序与空间组学等,灵活适应不同实验的需求。此外,公司提供了两种版本的产品,分别是预加载的(Illumina兼容测序接头)与未加载的(允许用户自定义添加接头),所有产品均经过严格的质量控制,以确保达到最高标准。

参考文献:1. Deng, Y., Bartosovic, M., Ma, S. et al. Spatial profiling of chromatin accessibility in mouse and human tissues. Nature 609, 375–383 (2022). 2. Farzad, N., Enninful, A., Bao, S. et al. Spatially resolved epigenome sequencing via Tn5 transposition and deterministic DNA barcoding in tissue. Nat Protoc 19, 3389–3425 (2024). 3. Martin, B. K., Qiu, C., Nichols, E. et al. Optimized single-nucleus transcriptional profiling by combinatorial indexing. Nat Protoc 18, 188–207 (2023).

尊龙凯时成立于2003年,总部位于比利时,是全球在表观遗传学产品领域的知名公司,专注于表观遗传学及二代、三代测序前样本处理的技术开发与应用,作为表观遗传学、生物样本制备及诊断的领先供应商。